Polymorphisme génétique de la dihydropteroate Synthétase de Plasmodium falciparum Pfdhps par la technique de séquençage des isolats collectés au cours de la chimio-prévention saisonnière du paludisme à Dioro, Missira et Sélingué

Abstract

La présente étude s’inscrit dans le cadre du Projet PMI 2018-2019 intitulé : "Evaluation de l’approche CPS : caractérisation moléculaire des gènes dhfr et dhps de Plasmodium falciparum associés à la résistance à la sulfadoxine et à la pyriméthamine à Sélingué, Missira et Dioro (Mali)". L’étude réalisée est de type transversal analytique et s’est déroulée d’octobre 2018 à juin 2019. Elle a porté sur des enfants de 3 à 59 mois se présentant au centre de santé et ayant reçus des doses de SP/AQ au cours de la campagne de CPS. L’étude consistait à prélever des échantillons de sang pour l’analyse des marqueurs moléculaires de la résistance à la SP. Objectif était de savoir si l’utilisation de la SP/AQ durant la campagne de protection contre le paludisme chez les enfants de 3 à 59 moins ne conduit pas aux parasites résistants a la sulfadoxine. C’est dans ce but que nous avons choisi 58 échantillons pour cette étude tous âgés de 0 3 à 59 mois et soumis au séquençage de leur gène Pfdhps. Un total de 13 séquences de bonne de qualité sur 58 a été obtenu et sélectionné pour la recherche de mutation sur le gène Pfdhps, soit un taux de réussite de 22,41%. Au cours de notre étude, nous avons détecté 13 souches portant les mutations sur les positions S436A, A437G, K540 E, A613S/P comme mutation connues à la résistance à la sulfadoxine mais aussi des mutations non connues à la position 613 aux acides aminés (F, G, Y et codon stop) de ce gène. Après analyse des séquences du gène Pfdhps, nous avons obtenu des mutations de type « transversion » aux positions 436 ; 437 et 540 qui entraine des variations génétiques entrainant des changements d’acides aminés. Il s’agissait notamment des changements respectifs suivants : TCT2>GCT Serine (S) en Alanine (A), GCT ->GGT Alanine (A) -> Glycine (G) et AAA-> GAA Lysine (K) ->Acide Glutamique (E) Au niveau de la position 613 nous avons révélé deux souches qui portent une variation génétique de type « transversion » entrainant un changement d’acide aminé GCC ->CCC Alanine (A) -> Proline (P) et GCC ->CCC Alanine (A) -> Serine (S) Cette position reste toute de même polymorphe avec la présence du changement d’acide aminé Alanine (A) en phénylamine (F), Tyrosine, Glycine (G) et codon stop Après avoir examiné la diversité du gène Pfdhps dans ces 3 sites d’études (Missira, Sélingué et Dioro), à partir du logiciel Geneious Prime version 2019.2.1 par la méthode Neighbor-joining et Tamura-Nei model utilisé comme modèle de distance génétique, nous avons observé qu’après L’analyse phylogénétique que les 13 souches sont génétiquement différentes.